Die Gemarkung Schönau befindet sich im Westen der Stadt Leipzig.
Sie grenzt im Norden an die Gemarkung Rückmarsdorf, im Osten an die Gemarkung Leutzsch, im Süden an die Gemarkung Kleinzschocher und im Westen an die Gemarkungen Lausen und Großmiltitz.
Ursprünglich verlief die Westgrenze der Gemarkung Schönau entlang der heutigen Kiewer Straße von der Gemarkungsgrenze zu Großmiltitz bis zur Alten Salzstraße, auf dieser weiter nach Westen bis zum Westrand der Siedlung Neugrünau (Grenzlinde), und am Westrand der Siedlung Neugrünau nach Süden bis auf die heutige Ratzelstraße (Gemarkungsgrenze zu Kleinzschocher). Auf diesem alten Teil der Gemarkung Schönau befanden sich das Dorf Schönau und das Rittergut Schönau.
Seit der Eingemeindung der Gemeinde Schönau am 01.04.1930 gehört die Gemarkung Schönau zum Territorium der Stadt Leipzig.
Im Jahr 1979 wurden große Teile der Gemarkungen Großmiltitz (mit der Kirschbergsiedlung) und Lausen nach Leipzig eingemeindet, auf denen in den 1980er Jahren die Wohnkomplexe 7 und 8 des Neubaugebietes Grünau errichtet wurden. Diese eingemeindeten Grundstücke der Gemarkungen Großmiltitz und Lausen wurden inzwischen ebenfalls in die Gemarkung Schönau eingeflurt.
Heute liegen folgende Ortsteile (wenigstens teilweise) auf der Gemarkung Schönau: Schönau (auf dem Nordteil der alten Gemarkung Schönau), Neulindenau (auf dem östlichen Südteil der alten Gemarkung), Grünau-Ost (auf dem mittleren Südteil der alten Gemarkung) und Grünau-Mitte (auf dem westlichen Südteil der alten Gemarkung) sowie Grünau-Nord (auf dem Nordteil des nach Schönau eingeflurten Teils der Gemarkung Großmiltitz), Grünau-Siedlung (auf dem östlichen Südteil des nach Schönau eingeflurten Teils der Gemarkung Großmiltitz mit der Kirschbergsiedlung) sowie Lausen-Grünau (auf dem westlichen Südteil des nach Schönau eingeflurten Teils der Gemarkung Großmiltitz und dem nach Schönau eingeflurten Teil der Gemarkung Lausen).